Insieme alle sinfonie "Haffner" e "Linzer", quest'opera viene considerata tra le massime realizzazioni di Mozart in campo sinfonico. Mozart scrisse la "Prager" a Vienna nell'autunno del 1786, portandola a termine il 6 dicembre.
La prima esecuzione si svolse il 19 gennaio dell'anno seguente al Teatro Nazionale di Praga, durante quel viaggio trionfale in cui Mozart venne salutato con giubilo dai praghesi, soprattutto per le sue "Nozze di Figaro".
